Il minareto innalzato da Abd al-Rahman III si conserva all'interno dell'attuale torre campanaria. Il Capitolo della Cattedrale prese l'iniziativa di restaurarla nel 1593, poiché era rimasta danneggiata a causa di una tempesta. Il progetto fu realizzato da Hernán Ruiz II, che demolì in parte l'antico minareto e completò il corpo delle campane. I lavori proseguirono nel XVII secolo, quando Juan Sequero de Matilla costruì il corpo dell'orologio. Alla fine di quel secolo furono rinforzate le fondamenta per il pericolo di crollo. Il campanile è opera di Gaspar de la Peña, che lo realizzò nel 1664. La scultura di San Raffaele in cima alla torre si deve agli scultori Bernabé Gómez del Río e Pedro de la Paz.